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国税庁KSK2で納税証明書の交付が1か月遅れ 会社の経理・情シスの備え

国税庁の新システムKSK2が2026年9月24日に稼働して以降、税務署窓口の納税証明書の交付などに時間がかかっています。国税庁の公式の案内と報道から、会社の経理・情シスへの影響、e-Taxの接続設定の変更点、問い合わせ方を整理しました。

公開 情シスのミカタ編集部AIにより執筆チェック済み
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国税庁KSK2で納税証明書の交付が1か月遅れ 会社の経理・情シスの備え

この記事のまとめ

  • 国税庁は、現金領収や納税証明書の交付などの窓口手続に通常より時間がかかるとの案内を、9月24日から出し続けています(10月19日更新)。
  • e-Taxで請求した納税証明書も遅れ、電子交付を選んでも書面になることがあります。電話番号をマイページに登録していないと手続が進みません。
  • KSK2の稼働でe-TaxのIPアドレスは固定から動的に変わりました。IPアドレスで許可設定をしている会社は、URLでの接続への切り替えが必要です。
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取引先から「納税証明書を出してください」と言われ、経理の担当者が税務署の窓口へ行ったところ、普段は待たない窓口で、何時間かかるか分からないと言われた。国税庁の新システム「KSK2」が稼働した2026年9月24日以降、こうした場面が全国で起きています。

日経クロステックは10月26日付の記事で、稼働から1か月がたった今も納税証明書の交付に通常より時間がかかり、国税労働組合総連合(国税労組)が解決を求めていると伝えています。国税庁は自分のサイトで案内を更新し続けており、この記事ではその公式の案内を中心に、会社の経理と情シスに関わる部分を整理します。

国税庁が案内していること

国税庁の「税務署窓口における各種手続について」は、9月24日の掲載後、28日・29日・10月19日に更新されています。10月19日版の中身は次のとおりです。

  • 現金領収、納税証明書の交付など、税務署窓口の各種手続に、通常より時間を要する場合がある
  • 窓口の業務に必要なシステムの稼働について、改善に取り組んでいる
  • 納税証明書は、e-Taxで請求しても通常より時間がかかる。電子交付を希望しても、書面での交付になる場合があり、その場合は税務署から連絡がある
  • 電子申請をするときは、マイページの「基本情報」の電話番号の欄に必ず登録する。登録がないと、税務署から連絡できず、手続を進められない
  • 電子申請の処理状況は、税務署に問い合わせる
  • 国税の納付は、ダイレクト納付、インターネットバンキング、クレジットカード納付、スマホアプリ納付などのキャッシュレス納付を使う
  • 状況は、あらためて国税庁のホームページで知らせる

あわせて、国税庁の納税証明書のページには、2026年10月1日から全国のすべての税務署で、総合窓口の受付時間を原則として午前9時から午後3時までとする、との記載があります。窓口の待ち時間と受付時間が重なり、午後に着くと間に合わない可能性があります。

e-Taxについては、9月25日(金)に一部の機能が使えない状況があり、国税庁(e-Tax)の9月27日付の更新で解消したと案内しています。9月25日午前0時から4時には、障害対応の緊急メンテナンスも実施されました。

うちの会社に影響するのはどの手続か

国税庁の案内は、遅れの対象を窓口の手続としています。会社の業務に当てはめると、次のように分かれます。

  • 影響する: 入札、融資、補助金、許認可の申請などで、納税証明書を求められる会社。請求から受け取りまでの日数が読めません。
  • 影響する: 税務署の窓口で、現金で税金を納めている会社。受付が午後3時までで、手続にも時間がかかります。
  • 影響する: e-Taxで納税証明書を請求し、電子交付を待つ会社。書面になる場合があり、電話番号の登録がないと止まります。
  • 影響しない: e-Taxの申告や、ダイレクト納付・インターネットバンキングなどのキャッシュレス納付が中心の会社。窓口の遅れは、直接はかかりません。
  • 影響しない: 納税証明書をふだん使わない会社。ただし、後で必要になったときの日数には注意が必要です。

還付金や申告の受付の遅れについて、国税庁の案内(10月19日版)は触れていません。処理状況を知りたいときは、案内にあるとおり、管轄の税務署に電話で聞きます。

窓口の遅れとは別に、会社の設定で確かめる変更点

KSK2の稼働では、窓口以外にも会社の側に関わる変更がありました。国税庁の「国税システムの更改について」から、情シスが関わるものを挙げます。

国税庁のページの切り出し。e-TaxのIPアドレスが固定から動的に変わったこと、旧字体の扱い、処分通知等の電子交付の事前の一括同意への変更が書かれている
国税庁が告知した、e-TaxのIPアドレスと電子交付などの変更出典: 国税庁「国税システムの更改について」(引用)

e-TaxのIPアドレスは、固定から動的(接続のたびに変わる)に変更されました。ファイアウォールやプロキシーで、e-TaxのIPアドレスを指定して通信を許可している会社は、URLで指定する設定に変更する必要があります。許可が古いままだと、e-Taxに接続できなくなるおそれがあります。

処分通知等の電子交付は、対象が広がり、同意の方法が「申請などの都度」から「事前の一括同意」に変わりました。電子交付を使っていた会社も、e-Tax上で一括同意の手続が必要です。

税務署から届く文書や納税証明書で使う漢字は、JIS X 0213の範囲になりました。旧字体の一部は字形が変わるか、手書きで表示されます。取引先や金融機関に出す書類の表記と食い違わないか、届いた証明書で確かめておくと安心です。納付書の「整理番号」(8桁)は、「お問い合わせ番号」(13桁)に変わりました。

会社・情シスが今日やること

  1. 納税証明書がいつまでに要るかを洗い出す。 入札、融資、更新の申請など、経理や総務が出す予定の書類を一覧にし、期限から逆算して請求日を前倒しします。
  2. e-Taxの電話番号を確認する。 会社のe-Taxのマイページを開き、基本情報の電話番号の欄が登録されているかを確かめます。担当者が退職していて、つながらない番号になっていないかも見ます。
  3. 接続の許可設定を確認する。 ファイアウォールやプロキシーの設定で、e-TaxのIPアドレスを指定しているものがあれば、URLでの指定に切り替えます。
  4. 電子交付の一括同意を済ませる。 電子交付を使う会社は、e-Taxで事前の一括同意の手続が済んでいるかを、経理の担当者に確かめます。
  5. 窓口へ行く日と時間を決める。 午後3時までの受付を前提に、午前のうちに着く日程にします。納付はキャッシュレスに切り替えられないか、検討します。

国税庁は、状況は改めてホームページで知らせるとしています。案内のページを週に1回ほど見て、改善の知らせが出たら、請求の予定を見直してください。

よくある質問

Q納税証明書は、いつ頃もらえますか。

A国税庁は、通常より時間を要する場合がある、と案内していますが、交付までの日数は示していません。入札や融資で期限がある場合は、管轄の税務署に先に電話し、余裕のある日程で請求します。

Q還付金や申告そのものも遅れますか。

A国税庁の案内(10月19日更新)が遅れると書いているのは、現金領収や納税証明書の交付など窓口の手続です。還付や申告の遅れには触れていません。処理状況が心配な場合は、税務署に問い合わせます。

Qe-Taxの別の不具合とは関係がありますか。

A10月2日に報じられた、贈与税の申告書が他人から見られた件とは別の問題です。日経クロステックも、KSK2とは別の不具合と伝えています。

出典・参考

チェック済み。この記事は監修者によってチェックされました。(2026年10月26日)

執筆

情シスのミカタ編集部AIにより執筆

書いた AI: AI記者(解説)

法令・官公庁の発表・企業の公式発表などの一次情報を調べて、情シス向けの解説・比較・テンプレの記事を書きます。数字と日付は出典と照らして確かめ、記事の最後に出典を載せています。使っているAI: Anthropic Claude。

監修

佐々木 航株式会社Game

代表取締役。工学部出身で、21歳で起業してからシステム会社の経営一筋で8期目。アプリの受託開発から始め、いまはAIを使ったシステムソリューションを手がけています。150社以上の企業とのプロジェクトで培った開発と情報システムの現場の経験と声を形にし、激動の時代を乗り越えたいと考えています。

メモ: 掲載時に自動で(しばらくの間)

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